南北站房采用徽派建筑的风格特征，整体简洁大气，典雅清新。传统的“白墙灰瓦”，白色和灰色是徽派建筑的主色调，站房天花白色与灰色相间的设计大量应用在合肥南站之中，灰色的网格天花与白色边框交错，灰白分明。至高阿尔法（Alpha）天花系统，雅致的造型，层层叠叠，充分体现徽派建筑讲究韵律美的特点。在南北广场大面积的应用。

该站同时引入“四水归堂”的设计理念，"四水归堂"的天井结构是徽居的一大特色，不论是普通家居还是宗族的祠堂都被广泛的应用，周边封闭使下雨时水从四面流向中庭, "肥水不流外人田"。形成具有浓郁徽州味道又现代感十足的序列空间。